Hx stompはmidiでスナップショットの切り替えができない、といいたいのでは?
実際はコントロールチェンジが送信できる機器ならスナップショットの切り替えは可能。ms-3なら問題なし。

色々制約のある機種なのは間違いないが、エフェクターではなくアンプ側で歪ませることを意識すればいい音出すと思うよ。あとは操作性がいいので俺は重宝してる。