匣母:中古の韻書で「匣」と同じカテゴライズをされた声母
   韻書によって微妙にカテゴリの内容が異なる
   およそ[ɣ]に近い発音だったと考えられる
喩母:中古の韻書で「喩」と同じカテゴライズをされた声母
   韻書によって微妙にカテゴリの内容が異なる
   およそ[j]に近い発音だったと考えられる
云母:中古でも比較的古い時代には匣母扱い、比較的新しい時代には喩母扱いをされたグループ
   古くは[ɣ]に近い発音だったが後の変化で[j]に近い発音へ変化したと考えられる

こんな感じなので、変化後の発音を日本語が取り入れただけじゃないのか?