本筋再掲

母音は下付きの数字（ア₂など）、
日本語にない子音は上付き数字（例えばthはサ²など）、
母音なしは下付き0（例えばkはカ₀など）でいいな

視認性よし、拡張性よし、しかもシンプルな表記がこれ
実際同種のものが別言語で採用実績あり
小書きの乱用は見にくいし、拡張性もない
どのカタカナに添字つけるかは議論の余地あり

↑になんかないの？