宮中だと諸大夫の座次は位階によるので摂家諸大夫＞大名諸大夫

殿中だと摂家諸大夫は摂家の家来として殿上之間御次という控之間に候して
大名と一緒に並ぶということがないので上下の規定はないかと

ただ仮に席次を決めるとすれば
大名四品（四位諸大夫）以上は必ず五位諸大夫の上席なので
やはり摂家諸大夫＞大名五位諸大夫となるか