3.1+5.9=9.0が減点になった理由ググってみたけど
結論としては.0という表記が余計であるという事らしい

実際は、.0があってもなくても数値としては同じであるけど
整数のみで表記できる数字の場合
誤表記を招く恐れがある等の理由で.0を省くよう教えてはいるけど
.0がある場合を間違いとするかどうかは指導員の判断に委ねているとの事

どちらかに統一した方がいいんじゃねとは思うけどね