強力な薬品や煮沸でもしない限り水道水で洗ってもバクテリアに大したダメージ無いよ
数年に1回程度でフィルターから水槽まで全部水道水でがっつり清掃してるけど清掃後に濾過が不安定になった事ない
ろ材の表面全てをブラシなどで綺麗に擦れば流石にヤバそうだけどそこまでやる奴はおらんだろう