確かに、本来削り落とすザクリの重さとマシンヘッドの金属部分の重さと
どちらがどれだけ重いのかは、わかりませんね。想像としては、それでもマシンヘッドの方が重いような気もしますが。

ただ、問題としては、
弦を留める部分の素材や、そこの重量が音に関係するのではないでしょうか。
留める部分が、金属か木かで、音の響きが変わると思います。