制作会社って店舗を建築する工務店みたいなもんで
建築後その店舗での売上の一部を工務店に払えってのはおかしいでしょ
建築代金は払ってるんだから
そういう事がしたいなら製作委員会との間で別に契約が必要

商標権がなくてもグッズは出せる。他人が真似しても排除できないけど