AOSが正史ならシールドは存続しているけど
そうでなくても、シャロンが「古巣の機関に空きがあれば復帰をのぞむかね？」と聞かれているので、シールドはあるんじゃないか

ニックフューリーは宇宙でスクラルたちとSWORDを結成していて
何らか宇宙の脅威が存在することが分かっているためハルクとキャプマは宇宙のどこかでそのために動いている
アベンジャーズのメンバーはそれぞれ個別に活動していて、何かあったら動き出すけど、本部らしい場所がないのと何よりまとめ役が不在

そんなところじゃないだろうか