デュアルアンプだとスイッチでアンプの切り替えできるじゃん。

両方に同じフットスイッチアサインしといて、片方onで片方offにしとけば、
フットスイッチ踏むたびに音切れ無しでアンプ切り替わる。

DSPに余裕があれば、エフェクトボードみたいな汎用パッチ組んどいて、曲中の音切れしないようにやりくりできるよ。