単にこの服はあなたに似合うだと
This clothes goes with you.
になりますよね。

go with…で …によく似合う

do you thinkは挿入句で邪魔なので消してしまいますと

Which color /goes best with/ this package design?

どの色が/一番良く似合いますか？/このパッケージデザインに

do you thinkをもとに戻すと

Which color /do you think /goes best with /this package design?

どの色が/あなたは思いますか/一番良く似合うと/このパッケージデザインに