天皇家のDNA鑑定を正確に行った場合、正直にいって
今上天皇の父系の先祖が本当に天智天皇である可能性はたぶん1/3くらいで、
残りの1/3は藤原鎌足、1/3はその他のだれか、ってところじゃないかと思う。

平安～鎌倉時代あたりの貴族社会の性の乱れを考えたら、そう考えるのが自然。
源氏物語では源氏の子が紛れて皇位を継いでしまうが、あれは源氏自身が帝の子だから許されるけど
長い時代に一度くらい、ああいったことを藤原氏の誰かがしていても全然おかしくない。
なので皇室が続く限り、DNA鑑定ってのはずっとタブーのままだろうね。