いや戦艦改造の航空戦艦をデザインするのに艦体後部を飛行甲板化するというセオリーをあえて外すこと自体は悪くないんだ。
外した【だけ】だからダメだったんで。

板をくっつけて飛行甲板でございというアタマ悪さとか
その薄っぺらい板に三段空母2隻分の航空機運用能力があるとかいう与太とか
発艦口と思しき部分が戦闘機の通れる大きさじゃないとか
船体部分との連絡路になる筈の後部兵装をつぶしたユニットがミサイル格納庫になってるとか
劇中では船体側がスライドパカパカで戦闘機を大量産卵だとか

要するにちゃんとアニメメカとしてのデザインも演出もされてなかったからダメだったんだ。