au回線のaupayだけのセキュリティ強化ですので
au回線以外のユーザーがいきなり使えなくなることはないとは思いますけど
なんせauさんがやられることなんで何が起きても不思議ではないかも。

それにしてもコンビニwifiでaupayですか、結構レアケースですね。
送金や出金ができるなら念のために残高0にしておくか
万一の場合はサポートTELですかね。