このシステムにどれだけお金が使われてるかは以下の情報を参照
http://www.tele.soumu.go.jp/j/sys/fees/purpose/manasys/index.htm
見直しに言及
http://www.tele.soumu.go.jp/resource/j/fees/purpose/reexam.pdf
(1) 無線局申請等処理
ア インターネット等を利用した
電子申請・届出及び申請手数料の
電子納付制度を導入したが、
利用を促進するための具体的な
フォローアップが十分とは言えず、
実際の利用件数も期待ほど伸びていない。
紙による申請に比較した利便性の向上、
効率的な処理を可能とするた
めの機能充実により電子申請に対する
インセンティブ向上を図る必要がある。

イ 無線局の申請時に提出を求めている
事項書・工事設計書の様式や記載項目について
申請の審査や無線局の監理上必ずしも
必要かつ適切な内容とはなっていない。
申請者の負担軽減と行政の効率化に向けて
柔軟に見直しを図る必要がある。

http://www.soumu.go.jp/main_content/000156176.pdf
平成24年の資料によれば
毎年3億円弱の運用経費
システムの整備で毎年2億円
合計毎年5億円かかっていることが判明
それでこのシステムかよｗ