というのも、iOS版であってもPebbleアプリが、そのアカウントでログインした時の挙動として、WFやアプリが、一覧にADD済みとして並びます。

アプリには、そのアカウントで新規に入ったという認識がされてないんだと思うんです。

なので、logoutして、rebble.ioからswitch to Rebbleしてあげられれば良いように思います。