田んぼとかもそうだけど水が動かない、水と接する表面が土とかで蓋されて
内側は酸素が少ない嫌気になってるだけ
自然と同じ状態だから根とか腐ってなきゃ別に問題はない
匂いがいやなら液肥と通水性の良い砂とかにすればいいし

水苔剥がして匂い嗅げば別に水苔が原因じゃないのわかるだろうけど
耐寒性強いからウィローモスとか撒いとく方法もあり
緑になってきれいになる